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處理胃酸藥物的種類不同，有中和胃酸型的，也有抑制胃酸型的，他們對身體機能的影響不同。

中和胃酸的藥物

這類藥物能用鹼把酸中和，使用媒介常是鈣、鋁、鎂。

比如碳酸鈣錠、碳酸鎂錠，能夠提供短期作用，大概2–4小時。以往研究常指出使用這類藥物能形成酸反彈（acid rebound），也就是用久了反而會讓胃酸製造過多了。但是近期研究發現，這類胃酸其實不會出現這樣的反應。

這類藥物的特質是，它不影響胃酸的正常分泌。

抑制胃酸的藥物

H2受體阻抗劑（H2 antagonist）這類抑制胃酸藥物，是直接讓胃壁細胞減少胃酸產量。它於使用後一小時開始作用。但是這類藥物中的雷尼替丁（Ranitidine），常用商品名Zantac，已經被美國食品藥物管理局禁用了，因為它致癌物過量。

氫離子幫浦阻斷劑（proton pump inhibitor, PPI），它也是抑制胃酸生產。但是這類藥物是長效型的藥物，所以它能夠影響吃藥後的每一餐胃酸分泌。

抑制胃酸型的藥物最大問題，就是它的戒斷反應–也就是你停止使用後的反應–就是讓胃酸分泌過多。

所以當你抑制胃酸藥物停用後，胃酸分泌反而會量過大，亦造成胃食道逆流。所以，如果原本有在使用抑制胃酸藥物的話，最好等待戒斷反應結束(大概四週到八週)，再開始使用天然保健品支援消化。

那到底該怎麼處理胃食道逆流呢？請參見：「胃食道逆流、脹氣、打嗝」。

所以如果你的消化已經導正，但是原本賁門已經受傷，然後產生閉鎖不全，那在睡前已消化完畢後，可以使用中和胃酸的藥物。這樣平躺時胃裡的酸能夠被中和，而減少賁門的損傷。